1、消化系统：可出现腹痛、胺胀、腹泻、恶心、呕吐等胃肠道刺激症状较早出现。若病情加重，可见胃肠绞痛，甚至出现上消化道出血，恶心、呕血，**鲜红而量多，或呈咖啡色，或呕吐物中夹杂血液，多呈咖啡色或紫暗成块。
2、血液系统：溶血，巩膜及全身皮肤黄染，贫血貌，酱油样小便。
板蓝根的毒性作用不明显，其不良反应主要表现为过敏反应，主要为板蓝根***所引起，部分人群服用药物可出现较为明显的消化道黏膜刺激征，甚至表现为胃肠绞痛和消化道出血。可能是由于板蓝根中所含有的靛玉红吸收缓慢，药物蓄积于胃肠，使其刺激增强所导致。
板蓝根可引起消化道出血，其出血原因，除了药物对胃肠道黏膜直接损伤刺激外，还可能和药物使用量过大，干扰机体的凝血过程有关。
板蓝根性苦寒，平素脾胃虚寒，尤其是平素怕冷、易腹泻者，板蓝根喝多了会导致消化不良、胃痛、食欲不振等不适。
