7月6日,西北农林科技大学园艺学院陈书霞教授团队在《Horticulture Research》上在线发表题为 “QTL mapping of fruit aroma compounds in cucumber (Cucumber sativus L.) based on the recombinant inbred line (RIL) population” 的研究论文,在黄瓜果实香气QTL定位研究及候选基因预测方面取得新进展,研究结果将为黄瓜果实风味改良提供指导。
独特的清香味是黄瓜果实的重要特色,是风味品质的重要组成部分,也是吸引消费者和增强市场竞争力的重要因素。一直以来,黄瓜清香味的形成和调控机理一直受到研究者的关注,但如何改良和调控果实形成适宜的风味,以适应国内外市场对果实品质不断提高的消费需求,是研究者一直关注的重要研究方向。青草味的C6醛类香气和花香味的C9醛类香气是构成黄瓜果实香气挥发物的主体成分。然而目前对黄瓜果实醛类香气物质含量的数量性状位点(QTL)及候选基因的研究进展较少。该研究基于Q16×Q24重组自交系群体的重测序数据构建了高密度遗传图谱。基于该图谱共检测到关于黄瓜主要醛类香气物质在2019年秋(2019a)和2020年春(2020s)两个季节的28个QTLs。它们分布在6条染色体上,这些QTLs解释了香气物质2.11%到39.30%的表型变异。
在C9醛类香气中,扫描到一个与C9醇类特征香气(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol相关的主效QTL,命名为qol8-2.1,分别解释该香气物质的11.76%(2019a)和17.53%(2020s)。qol8-2.1位于染色体2上mk190和mk204标记之间,物理位置在19.80 cM~25.53 cM之间。通过基因组扫描发现,该区间有9个脂氧合酶基因,其中CsLOX08基因表达水平与(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol含量呈显著正相关,且双亲中的CsLOX08蛋白在双亲间具有5个氨基酸的变异。此外,与Q16相比,在Q24 DNA基因组的第五个内含子发现了8 bp的插入变异。因此,初步把CsLOX08推测为qol8-2.1的候选基因。
基于CsLOX08基因在亲本中的插入变异,本研究开发了一个功能性InDel分子标记。基于该InDel标记对RIL群体中进行基因分型,结果表明,CsLOX08可能是qol8-2.1位点的候选基因,且开发的功能性InDel分子标记可作为C9醛类香气(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol含量的分子辅助育种筛选标记。该研究为黄瓜果实香气的合成及调控机制奠定了理论基础。
陈书霞教授为该论文通讯作者,博士研究生孙银辉和李许真为该论文的共同第一作者。该研究获得国家重点研发计划、国家自然科学基金的资助。
原文链接:https://doi.org/10.1093/hr/uhac151
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